Przełomowa „mapa raka” zmieni przyszłość leczenia nowotworów
-
Nadrzędna kategoria: Wiadomości Naukowe
Ponad tysiąc naukowców z 37 krajów i 10 lat ciężkiej pracy w ramach projektu „Pan-Cancer”. Efekt? Niemal kompletny obraz wszystkich znanych nowotworów. Umożliwi on w przyszłości tworzenie indywidualnych terapii dla pacjentów oraz wcześniejsze wykrywanie raka. Wyniki badań zamieściło prestiżowe czasopismo „Nature”, a współautorem publikacji jest prof. Jan Komorowski z Instytutu Podstaw Informatyki PAN.
Międzynarodowe konsorcjum Pan-Cancer przeanalizowało kompletny kod genetyczny dokładnie 2.658 typów raka. Naukowcy znaleźli 4-5 głównych mutacji, które sterują rozwojem nowotworu. To „czułe punkty” napędzające chorobę. Można w nie uderzyć, projektując odpowiednią terapię, dostosowaną indywidualnie do potrzeb pacjenta.
Badacze odkryli, że 20% mutacji powstaje wiele lat, a nawet dziesięcioleci przed rozwojem schorzenia. To otwiera furtkę do stworzenia narzędzi umożliwiających wcześniejsze wykrywanie raka.
W projekcie Pan-Cancer uczestniczył m.in. prof. Jan Komorowski z Instytutu Podstaw Informatyki PAN. Wkład jego zespołu to przede wszystkim wykrywanie istotnych mutacji w tzw. obszarach regulatorowych genomów za pomocą bioinformatycznej analizy dużych zbiorów danych.
Prof. Jan Komorowski jest współautorem 6 artykułów podsumowujących badania, które ukazały się w czasopismach „Nature”, „Nature Communications” i „Communications Biology”.
Publikacje naukowe
- Rheinbay, E., Nielsen, M.M., Abascal, F. et al.Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes. Nature 578, 102–111 (2020).
- Campbell, P.J., Getz, G., Korbel, J.O. et al.Pan-cancer analysis of whole genomes. Nature 578, 82–93 (2020).
- Carlevaro-Fita, J., Lanzós, A., Feuerbach, L. et al.Cancer LncRNA Census reveals evidence for deep functional conservation of long noncoding RNAs in tumorigenesis. Commun Biol 3, 56 (2020).
- Reyna, M.A., Haan, D., Paczkowska, M. et al.Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomes. Nat Commun 11, 729 (2020).
- Paczkowska, M., Barenboim, J., Sintupisut, N. et al.Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics data. Nat Commun 11, 735 (2020).
- Shuai, S., Abascal, F., Amin, S.B. et al.Combined burden and functional impact tests for cancer driver discovery using DriverPower. Nat Commun 11, 734 (2020).
Źródło informacji: Instytut Podstaw Informatyki PAN